Два месяца тюремного заключения позади. Хаус выходит на свободу благодаря настоятельной просьбе нового декана медицины, Формана. Вокруг всё изменилось. Старый офис и команда остались в прошлом, а лучший друг Уилсон не скрывает гнева и разочарования. Теперь в распоряжении Хауса лишь робкий ординатор доктор Чи Парк и новый сложный случай. Пациент, которому пересадили донорские лёгкие, внезапно начинает терять их функции. Жизнь мужчины под угрозой.
Хаус погружается в расследование, пытаясь разгадать медицинскую загадку. Он сталкивается с сопротивлением со стороны Парк, но её молодой ум и настойчивость помогают найти истину. Финальный диагноз звучит как эозинофильный пневмонит. Эта редкая патология подталкивает Хауса к нестандартным методам лечения, которые в последний момент спасают пациента.
Несмотря на профессиональный успех, Хаус осознаёт, что его дружба с Уилсоном висит на волоске. Впереди нелёгкий путь восстановления не только команды, но и собственного статуса в больнице. Второй эпизод финального сезона задаёт тон всей дальнейшей драме.